Bien que le Dr John Watson n'apparaisse pas dans Enola Holmes, le film contient une brève allusion à Watson à travers un indice impliquant un bouquet de fleurs.
Enola Holmes n'inclut pas l'assistant d'enquête de Sherlock, le Dr John Watson, mais il reçoit une référence subtile au cours de l'intrigue du film. Depuis que le film suit Enola alors qu'elle tente de découvrir où se trouve sa mère disparue, Eudoria (Helena Bonham Carter) et crée sa propre agence de détectives dans le climat patriarcal de l'Angleterre victorienne, la plupart des personnages emblématiques des sources d'Arthur Conan Doyle, y compris Mycroft (Sam Claflin), Lestrade (Adeel Akhtar) et Sherlock (Henry Cavill) lui-même, jouent des rôles antagonistes secondaires en tant qu'obstacles à surmonter pour Enola au cours de son enquête.
Alors que la première enquête canonique de Sherlock et Watson Une étude en écarlate a lieu en 1881, Enola Holmes suggère que le duo dynamique ne s'est pas encore rencontré bien qu'il se déroule en 1884. À plusieurs reprises, le frère aîné d'Enola, Sherlock, est décrit comme un solitaire. Quand Enola se fait passer pour l'assistante de Sherlock pour visiter le domaine de Tewkesbury, l'inspecteur Lestrade affirme que Sherlock travaille toujours seul. Lorsque Sherlock rend visite à Edith Grayston (Susan Wokoma) dans son salon de thé, elle déclare que Sherlock a pas d'amis, juste un métier étrange. Alors qu'Enola expose sa vie, une coupure de journal qualifie Sherlock de jeune détective, ce qui suggère que Enola Holmes suit Sherlock pendant les six années où il a travaillé comme détective sans Watson. Bien que Watson ne soit pas physiquement présent pendant Enola Holmes , le médecin légendaire est brièvement évoqué à travers un indice laissé par Eudoria.
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Quand la mère d'Enola, Eudoria, disparaît au début de Enola Holmes , elle laisse derrière elle un paquet rempli d'indices qu'Enola doit déchiffrer. Dans ce paquet, Enola découvre l'un des puzzles de mots de sa mère : un bout de papier imprimé avec une série de lettres aléatoires qu'Enola décode pour lire. Enola, regarde dans mes chrysanthèmes. Suivant l'indice, Enola parcourt Le Langage des fleurs livret que sa mère a laissé derrière elle et découvre que les chrysanthèmes symbolisent attachement familial et affection. Après avoir fouillé le vase de chrysanthèmes dans la chambre de sa mère et n'avoir rien trouvé, Enola découvre alors que sa mère faisait référence aux images de chrysanthèmes qu'elle a peintes. Alors que cet indice amène Enola à découvrir l'enveloppe d'argent cachée dans le tableau d'Eudoria qui fournit les fonds pour son voyage et relance l'intrigue, un indice similaire agit comme un catalyseur dans un autre. Enola Holmes livre impliquant le Dr Watson.
Dans L'affaire des bouquets bizarres : un mystère d'Enola Holmes, Enola découvre que le partenaire de Sherlock, le Dr Watson, a été emprisonné dans un asile de fous après avoir envoyé un message à travers un bouquet de fleurs. Décidant d'aider Sherlock en résolvant la disparition du Dr Watson, Enola rend visite à Mme Watson sous le pseudonyme de Viola Everseau et observe qu'un étrange bouquet de fleurs envoyé à leur domicile symbolise la mort. En suivant le bouquet jusqu'à un magasin de costumes, Enola révèle que la sœur du propriétaire du magasin, Flora, était une ancienne patiente du Dr Watson, qu'il a autorisé à admettre à l'asile. Par vengeance, Flora a trompé les employés de l'asile pour qu'ils admettent Watson sous le nom d'un beau-frère qu'elle a assassiné. Compte tenu de sa connaissance du langage des fleurs et de l’expertise de Watson en tant qu’horticulteur, Enola finit par déchiffrer l’appel à l’aide de Watson et informe Sherlock de l’endroit où il se trouve.
Pendant que l'œuf de Pâques de Watson Enola Holmes est facilement manqué, cela ajoute un autre niveau de profondeur au film, notamment en ce qui concerne la dynamique de Sherlock et Enola. Lorsque Sherlock et Enola parlent de la disparition d'Eudoria, Sherlock suggère à Enola d'arrêter d'être inutilement émotive et de résoudre le mystère en recherchant la vérité. Leur conversation montre que Sherlock considère la raison et l'émotion comme des idéaux opposés, car il pense que les sentiments personnels d'Enola l'empêchent de résoudre le mystère. Cependant, Enola résout le chiffre d'Eudoria mes chrysanthèmes en utilisant sa connaissance personnelle de sa mère tandis que Sherlock, ne suivant rien d'autre que la piste de preuves pour le conduire au tableau, est un pas derrière Enola. Puisque Sherlock ne comprend pas vraiment l'importance de nouer des relations jusqu'à ce que Watson entre dans sa vie, l'indice du bouquet dans le film Enola Holmes met efficacement en évidence les forces d’Enola et les faiblesses de Sherlock en tant que détective sans Watson.
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